當(dāng)納稅人由核定征收轉(zhuǎn)為查賬征收后，為降低風(fēng)險(xiǎn)，減少損失，在年度匯算清繳時(shí)應(yīng)當(dāng)對(duì)核定征收期間結(jié)轉(zhuǎn)過來的成本費(fèi)用一一進(jìn)行合法性、真實(shí)性、配比性分析，對(duì)在核定征收期間虛增或者應(yīng)轉(zhuǎn)未轉(zhuǎn)、少轉(zhuǎn)的成本費(fèi)用不能結(jié)轉(zhuǎn)到查賬征收期間扣除。
權(quán)責(zé)發(fā)生制和收入與成本費(fèi)用配比是在查賬征收企業(yè)所得稅（以下簡(jiǎn)稱查賬征收）情況下確認(rèn)收入與成本費(fèi)用的基本原則，而在按收入總額核定定率和按核定定額征收企業(yè)所得稅（以下統(tǒng)稱核定征收）的情況下，其成本費(fèi)用支出額、扣除額都是不真實(shí)的，因此，當(dāng)納稅人由核定征收轉(zhuǎn)為查賬征收后，為降低風(fēng)險(xiǎn)，減少損失，在年度匯算清繳時(shí)應(yīng)當(dāng)對(duì)核定征收期間結(jié)轉(zhuǎn)過來的成本費(fèi)用一一進(jìn)行合法性、真實(shí)性、配比性分析，對(duì)在核定征收期間虛增或者應(yīng)轉(zhuǎn)未轉(zhuǎn)、少轉(zhuǎn)的成本費(fèi)用不能結(jié)轉(zhuǎn)到查賬征收期間扣除，具體內(nèi)容如下：
1．已列支應(yīng)扣除未扣除的成本費(fèi)用不能結(jié)轉(zhuǎn)到查賬征收期間扣除。如在核定征收期間未提足的固定資產(chǎn)、無形資產(chǎn)、生物資產(chǎn)折舊以及商品生產(chǎn)或者購進(jìn)成本、開辦費(fèi)、新產(chǎn)品新技術(shù)研究開發(fā)費(fèi)及其加計(jì)扣除部分、待攤費(fèi)用、廣告和業(yè)務(wù)宣傳費(fèi)、職工教育經(jīng)費(fèi)支出等等。
2．虛列的成本費(fèi)用不能結(jié)轉(zhuǎn)到查賬征收期間扣除。包括無憑證和以非法憑證列支的成本費(fèi)用，如白條、非法**和不符合規(guī)定的**、非資產(chǎn)評(píng)估機(jī)構(gòu)出具的評(píng)估報(bào)告等等。
3．應(yīng)列支未列支的期間費(fèi)用不能結(jié)轉(zhuǎn)到查賬征收期間扣除。包括已開具**未列支和實(shí)際業(yè)務(wù)已發(fā)生但未開具**也未列支兩部分，如：管理費(fèi)用、銷售費(fèi)用、財(cái)務(wù)費(fèi)用以及應(yīng)由已售出貨物或已提折舊負(fù)擔(dān)的應(yīng)記入成本的采購費(fèi)用、運(yùn)輸費(fèi)用、維護(hù)維修費(fèi)用等等。
4．遺留事項(xiàng)，包括以下內(nèi)容：
?。?）對(duì)外投資應(yīng)分配未分配的虧損、待處理損失（含2009年以前發(fā)生的尚未處理的權(quán)益性股權(quán)投資損失）。
?。?）未抵免的從其直接或者間接控制（20%以上股份）的外國企業(yè)分得的來源于中國境外的股息、紅利等權(quán)益性投資收益已由外國企業(yè)在境外實(shí)際繳納的所得稅稅額中屬于該項(xiàng)所得負(fù)擔(dān)的部分。
?。?）應(yīng)繳未繳的基本養(yǎng)老保險(xiǎn)費(fèi)、基本醫(yī)療保險(xiǎn)費(fèi)、補(bǔ)充養(yǎng)老保險(xiǎn)費(fèi)、補(bǔ)充醫(yī)療保險(xiǎn)費(fèi)、失業(yè)保險(xiǎn)費(fèi)、工傷保險(xiǎn)費(fèi)、生育保險(xiǎn)費(fèi)等基本社會(huì)保險(xiǎn)費(fèi)和住房公積金。
因此，除上述之外，在保證結(jié)轉(zhuǎn)的成本、費(fèi)用合法、準(zhǔn)確、及時(shí)，并在核定征收期間已足額扣除的情況下，結(jié)轉(zhuǎn)到查賬征收期的下列成本費(fèi)用準(zhǔn)許在所得稅前扣除：
1．固定資產(chǎn)、無形資產(chǎn)、生物資產(chǎn)折舊。
2．原材料、庫存商品以及在產(chǎn)品成本。
3．超過扣除限額后結(jié)轉(zhuǎn)的職工教育經(jīng)費(fèi)支出。
4．超過扣除限額后結(jié)轉(zhuǎn)的廣告費(fèi)和業(yè)務(wù)宣傳費(fèi)。
5．2008年1月1日前按照原企業(yè)所得稅法規(guī)定計(jì)提的各類準(zhǔn)備金，轉(zhuǎn)為查賬征收后，未經(jīng)財(cái)政部和國家稅務(wù)總局核準(zhǔn)的，企業(yè)實(shí)際發(fā)生的相應(yīng)損失，應(yīng)先沖減各項(xiàng)準(zhǔn)備金余額，然后再按稅法規(guī)定記入當(dāng)年損益。
6．居民企業(yè)來源于中國境外的應(yīng)稅所得以及非居民企業(yè)在中國境內(nèi)設(shè)立機(jī)構(gòu)、場(chǎng)所取得發(fā)生在中國境外但與該機(jī)構(gòu)、場(chǎng)所有實(shí)際聯(lián)系的應(yīng)稅所得已在境外繳納的所得稅稅額，已按規(guī)定抵免后需要在以后五個(gè)年度內(nèi)用每年度抵免限額抵免當(dāng)年應(yīng)抵稅額后的余額抵補(bǔ)且未超過抵免期限應(yīng)抵免的數(shù)額。
